美国基因组检测和奶牛行业现状

林赛·沃顿 美国荷斯坦协会基因服务执行总监

随着全基因组选择技术在奶牛育种上的应用，奶牛生产效率随时间推移获得大幅提升。淘汰遗传潜力低的牛，降低饲养成本；确保后备牛群具备高生产性能潜力；养更少的牛，获得更多的奶；盈余后备牛的价值最大化。

美国每年荷斯坦牛的基因检测数量逐年递增，截至2020年9月，累计检测340万头。基因检测品种包括荷斯坦、娟姗、瑞士褐牛。遗传进展是基因组育种的划时代意义，2010年及以前出生的牛群，还不明显，但2015年的新基准群，相较于2010年的基准群，遗传进展主要得益于基因组选择育种技术。遗传育种对表型提升贡献，增加了健康和繁殖的权重，繁殖力进展上更多新性状和更高特异性等。

美国大型牧场做基因组检测的比例更高，大多的美国牧场利用基因组检测结果做育种策略，提升下一代的遗传品质，使用综合育种指数如健康净价值（DWP$）做分组排名和不同策略。TPI高低不同的牧场，从2010到2018年，仍能生存的比例相差2倍。你的牧场遗传进展必须跟上或超越行业或其他牧场的遗传进展速度，才能保证不出局。若要超越同行，请使用基因组选择育种的工具。

国内基因组检测与奶牛育种介绍

孙东晓 中国农业大学 教授

中国农业大学、中国奶业协会于2018年共收集了来自27个省市自治区、2018个牛场的1584头公牛的32.7万个女儿的503128条DHI记录，1179头公牛的4.9万个女儿的头胎体型记录,进行中国荷斯坦牛基因组选择效果验证，产奶性能基因组选择效果显著。

公牛基因组选择应用比较成熟，母牛群基因组选择可应用于早期淘汰后备牛，犊牛、出售/购买；作为核心群母牛、优质胚胎选择的依据和标准；选配：购买最佳组合的冻精，降低近交；低密度芯片：7K、9K、20K成本低。还可应用于更多遗传缺陷检测（单倍型检测）和更多新的选择性状：难度量、表现晚的性状。

基因组选择在母牛上的应用：在成母牛规模保持恒定的情况下，每年生产的青年母牛多于群体更新所需要的青年母牛；选留遗传上优秀的青年母牛用于群体更新；评估时随机选留，根据父母遗传优劣性选留（系谱指数），可靠性30%，而基因组选择可靠性~60%，大约相当于利用3-4个泌乳期表型记录进行遗传评估的可靠性。提高淘汰牛的准确性，合理配种决策，更好的避免近交。

奶牛场基因组检测的应用

杰森·奥斯特 硕腾全球副总裁/硕腾全球基因组检测负责人

基因组检测数据与选择策略。1.淘汰育成牛：哪头牛遗传潜力高需要留下，哪头牛价值低需要淘汰。2.冻精类型选择：决定哪些牛使用性控精液，哪些牛使用普通精液，哪些牛使用肉牛精液，决策取决于希望这头牛在群体里希望有多少数量的后代。3.选配公牛：利用基因组数据选择正确的公牛与配。发挥现有的遗传优势，避免遗传劣势进一步发展；避免产生纯合缺陷型。4. 胚胎移植：识别群体中最优秀的母牛，作为胚胎移植供体，加速后代在群体中的数量，使用繁殖性状较好的排名较差的牛作为胚胎移植受体牛。

在系谱树的上半部分，使用优质公牛来管理遗传变异。另外一半呢？拒绝基因组检测，就像配种只使用了半支细管冻精或挤奶只挤了2个乳区，牛群虽然也在进步，实际上鸭行鹅步，半速前进。

通常我们假设子代的遗传水平就是父母的完美混合，子代的表型值也是父母表型值的平均。但实际上DNA的传递不是简单完美的组合，传递给后代的染色体片段复杂而难以预测。基因组检测让我们清楚染色体上的片段来源于哪位先祖，使更准确的遗传评估成为可能。

有选择, 育成牛平均遗传水平就高于成母牛；但并不是所有的育成牛都比在群成母牛好。以基因组数据洞见遗传潜力，延续公牛侧选择的进展；实际案例证明全基因组选择育种技术的有效和准确。心动不如行动，开始检测你的牛群，制定育种策略，突破遗传的天花板，获取更大的经济效益。